La decisión ya está tomada: después del partido contra Paraguay, Walter Flores cerrará definitivamente su ciclo en la Selección nacional. A los 38 años, el referente que volvió de la mano de Hoyos jugará su último partido con la camiseta de La Verde, poniéndole fin a una historia que empezó hace poco más de doce años.
Sus primeros partidos defendiendo los colores del país fueron en la Copa América de Perú, cuando aún militaba en San José. Después, participó en varios partidos de las Eliminatorias rumbo al Mundial de Sudáfrica, la Copa América de Argentina y las Eliminatorias para el Mundial de Brasil, donde anotó su único gol, frente a Colombia.
En total, disputó 29 partidos con la casaca del conjunto nacional (ganando apenas cuatro, sin contar el último, que la FIFA le otorgó a Perú), marcando un gol, recibiendo once tarjetas amarillas y sin sufrir expulsiones.