Bolívar empezó con el pie derecho en la Copa Libertadores con una importante victoria por 2 a 3 sobre Deportivo Lara y rompió la mala costumbre de no ganar en su primer partido de visitante desde que salió victorioso de Brasil el 2002.
El 4 de febrero de ese año los celestes se llevaron la alegría superando al Athletico Paranaense por 1 a 2 con tantos de Alex Mineiro para los locales, Edgar Olivares y Joaquín Botero para la visita.
El registro también incluía los debuts como local. El 7 de febrero del 2006 la academia ganó por última vez en su debut, en este caso jugando como local, fue frente a Estudiantes de La Plata con gol de Limberg Gutiérrez.