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El técnico de la Selección nacional tiene un registro corto de enfrentamientos contra Paraguay. En su trayectoria como jugador, jugó tres partidos contra los guaranís por Eliminatorias, cosechando un empate, una derrota y una victoria.
En las Eliminatorias rumbo al mundial de Francia 1998, formó parte del equipo que empató sin goles en el estadio Hernando Siles, en diciembre de 1996.
El único partido de esta naturaleza que disputó en Asunción fue en la derrota de la Verde por cinco tantos contra uno, en el año 2001. El gol boliviano había sido anotado por Líder Paz a los quince minutos de iniciado el compromiso, poniendo a la Verde transitoriamente en ventaja.
Finalmente, fue parte del equipo que venció por dos a uno a la Selección Albirroja en el año 2005. En aquella ocasión, la Verde se impuso con goles de Luis Héctor Cristaldo y Roger Suárez. El Emperador disputó los noventa minutos del partido y participó del primer gol, que se originó a partir de un tiro libre que ejecutó.
